制订全市畜禽渔业品种繁育和改良规划，指导引进、生产、繁育和推广畜禽渔业良种。负责大型种畜禽场生产经营许可证和渔业捕捞许可证的发放。

负责全市畜禽良繁体系建设工作；指导各县（市、区）做好种畜禽生产经营许可工作。

指导各县（市、区）做好畜禽规模养殖场备案和养殖档案管理工作。

负责畜禽规模养殖粪污综合利用的指导。

负责畜禽品种改良工作。

指导和监督全市水产养殖证和苗种生产许可证核发备案和水产苗种生产监督管理工作。

负责水生野生动植物的保护管理和开发利用。

负责全市全市机动渔船登记管理，机动渔船及船用产品的法定检验，渔业职务船员、普通船员的考试、发证工作。

负责黄壁庄水库渔业捕捞许可，负责黄壁庄水库渔业资源增殖保护费征收。